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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Études structurales de peptides antibiotiques de type peptaibol provoquant des modifications membranaires par spectroscopies RPE pulsée et RMN de l’état solide

SALNIKOV, Evgeniy (2007) Études structurales de peptides antibiotiques de type peptaibol provoquant des modifications membranaires par spectroscopies RPE pulsée et RMN de l’état solide. Thèses de doctorat, Université Louis Pasteur.

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Résumé

Au cours de cette thèse, la structure, la dynamique et la topologie de peptides peptaibols ont été étudiées par résonance magnétique. Nous nous sommes focalisés sur trois membres de la famille des peptides peptaibol : la Trichogin GA IV, l’Ampullosporin A et l’Alamethicin qui ont des longueurs et des activités biologiques différentes. La RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) du solide orientée nous a permis de déterminer l’orientation, et la structure des trois peptides marqués en azote 15 dans les bicouches lipidiques.En utilisant des peptides marqués avec un groupement TOAC (2,2,6,6-tetramethylpiperidine-1 -oxyl- 4-amino-4-carboxylic acide) nous avons pu appliquer une technique de RPE (Résonance Paramagnétique Electronique) récemment développée l’ESEEM (electron spin echo envelope modulation) ainsi que la RPE à onde continue sur la Trichogin et l’Alamethicin, ce qui nous a donné accès à la topologie et à l’état d’oligomerisation de nos peptides. Nos résultats indiquent des propriétés similaires pour les trois peptides. L’adéquation entre la longueur hydrophobe du peptide et celle des chaînes lipidiques semble être le facteur déterminant l’orientation du peptide dans les bicouches. Les trois peptides dans leur orientation transmembranaire sont également structurés sur une longueur importante en hélice 310. C’est également la première fois que des oligomères d’alamethicin transmembranaires sont directement observées. Un autre aspect important de ce travail est que nous avons étudié par deux méthodes de résonance magnétique exactement la même molécule : l’alamethicin en présence de bicouche lipidique. Ceci nous permet donc d’obtenir plus d’information sur les interactions peptides/membranes mais aussi de pouvoir comparer les deux techniques.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Discipline de la thèse / mémoire / rapport :Chimie
Mots-clés libres:peptides, peptaibol, résonance magnétique, RMN, Trichogin GA IV, l’Ampullosporin A, Alamethicin, modification, Résonance Paramagnétique Electronique, RPE, oligomérisation, interactions peptides membranes
Sujets:CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 530 Physique > 535 Lumière visible (optique) et phénomènes de l'infrarouge et de l'ultraviolet > 535.8 Applications. Spectroscopie. Phénomènes de l'infrarouge et de l'ultraviolet
Classification Thèses Unistra > Sciences, technologies > Sciences de la nature et mathématiques > 530 Physique > 535 Lumière visible (optique) et phénomènes de l'infrarouge et de l'ultraviolet > 535.8 Applications. Spectroscopie. Phénomènes de l'infrarouge et de l'ultraviolet

UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-3 Chimie, matériaux, plasturgie
CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines

UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-20 Physique, chimie, matériaux
Code ID:1388
Déposé le :18 Janvier 2008

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