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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Universalité des méthodologies protéomiques pour l'identification et la caractérisation des protéines

FOUILLEN, Laetitia (2009) Universalité des méthodologies protéomiques pour l'identification et la caractérisation des protéines. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

La grande diversité des problèmes biologiques abordés ces dernières années par l’analyse protéomique a montré que celle-ci devait être encore développée en fonction du type de question posée mais aussi en fonction des contraintes techniques imposées par les échantillons. Les méthodologies protéomiques sont composées de plusieurs étapes mettant en jeu la préparation d'échantillon, la séparation des protéines et peptides et enfin l'analyse des protéines et peptides par spectrométrie de masse suivie de l'interprétation des données générées. Les études présentées ont nécessité d'adapter ces différentes étapes pour répondre au mieux aux diverses questions biologiques abordés au cours de cette thèse : L'identification des protéines impliquées dans des complexes protéine/protéine et ARN/protéine : une stratégie protéomique impliquant une purification du complexe d'intérêt et des analyses par nanoLC-MS/MS a pu être développée. La caractérisation fine des protéines phosphorylées purifiées : une méthodologie adaptée, en deux étapes, a été mise en place pour la détermination de l'état de phosphorylation des protéines entières et la localisation des sites exacts de phosphorylation sur le squelette peptidique. L'identification et la quantification relative des protéines plasmatiques exprimées chez le manchot Adélie lors du jeûne prolongé à l'aide d'une stratégie de quantification par analyse d'image et d'une stratégie d'identification par des approches d'interprétation des données MS/MS. Ces travaux de thèse montrent l’universalité des approches protéomiques, qui devront toujours être adaptées très finement pour garder leur potentiel pour l’analyse d’échantillons provenant d’origines diverses et de complexités variables.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Mots-clés libres:spectrométrie de masse ; chromatographie liquide ; modifications post-traductionnelles ; méthodologies protéomiques
Sujets:UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-3 Chimie, matériaux, plasturgie
CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines

UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
Code ID:1660
Déposé le :01 Octobre 2009

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