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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Identification et caractérisation des gènes cibles du corépresseur TIF1β : vers une meilleure compréhension de son rôle en tant que régulateur épigénétique de l'activité transcriptionnelle du génome murin

RICLET, Raphaël (2009) Identification et caractérisation des gènes cibles du corépresseur TIF1β : vers une meilleure compréhension de son rôle en tant que régulateur épigénétique de l'activité transcriptionnelle du génome murin. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

Mon travail de thèse a porté sur l’identification et la caractérisation des gènes directement régulés par TIF1β dans les cellules de carcinome embryonnaire F9. Par analyse transcriptomique et ChIP, nous avons identifié MEST comme un gène cible primaire de TIF1β. Nous avons ensuite démontré que TIF1β est essentiel à l’établissement et à la maintenance d’une structure de type hétérochromatine dans la région promotrice de ce gène, caractérisée par la triméthylation de H3K9 et de H4K20, l’ hyperméthylation de l’ADN et un enrichissement en protéines HP1. Enfin, cette structure semble entrainer une localisation préférentielle du gène MEST à proximité de l’hétérochromatine. Nous avons démontré que cette organisation nécessite l’interaction entre TIF1β et les HP1, puisqu’elle est complètement perturbée dans des cellules F9 qui expriment une protéine TIF1β n’interagissant plus avec les protéines HP1. Dans ces cellules, le promoteur MEST est hypométhylé et caractérisé par une triméthylation de H3K27, associée à la réactivation de l’expression de ce gène et à son éloignement de l’hétérochromatine.Par des expériences de ChIP-seq réalisées dans des cellules F9 au cours de la différenciation cellulaire, nous avons mis en évidence un grand nombre de régions du génome enrichies en TIF1β correspondant principalement à des régions promotrices proximales et distales. Cette étude nous a permis d’établir que TIF1β régule majoritairement des gènes impliqués dans l’expression des gènes, la mort cellulaire, la croissance et la prolifération cellulaire ainsi que dans le cancer; cette analyse suggère aussi que TIF1β pourrait jouer un rôle au niveau des séquences répétées de type LTR et SINE.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Discipline de la thèse / mémoire / rapport :Sciences du vivant. Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Sujets:CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique

UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-5 Santé, industrie du médicament, cosmétique
CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines

UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
Code ID:1679
Déposé le :17 Novembre 2009

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