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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Etude structurale du complexe des récepteurs nucléaires RXR/VDR liés à l’ADN par cryo-microscopie électronique et reconstruction 3D

ORLOV, Igor (2010) Etude structurale du complexe des récepteurs nucléaires RXR/VDR liés à l’ADN par cryo-microscopie électronique et reconstruction 3D. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

Les récepteurs nucléaires sont une classe de protéines qui régulent l'expression de gènes spécifiques de manière à contrôler des processus moléculaires impliqués dans le développement, l'homéostasie et le métabolisme. Ces protéines ont la capacité de se lier directement à l'ADN qui est unique en comparaison avec d'autres classes de molécules réceptrices, et en présence du ligand ils régulent l'expression des gènes adjacents à la région promotrice. Nous avons utilisé la cryo-microscopie électronique de particules isolées (cryo-ME) afin d’étudier l'architecture d'un ensemble représentatif des récepteurs nucléaires avec l'ADN. Nous avons déterminé la structure du complexe VDR-RXR des récepteurs nucléaires sur un fragment d'ADN court (20 paires de base) dans des conditions cryo à une résolution de 10-12Å. La structure du complexe révèle que hétéro dimère LBD est une unité assez rigide et stable au sein du complexe même en présence de DBDs et l'ADN. Notamment, la structure du complexe RXR / VDR avec l’ADN montre que hélice H12 de transactivation et le site de liaison du co-activateur VDR pointe vers la direction 3 'et side-on à l'ADN (en face de la DBDs), suggérant que les co-activateur agit en aval de l'élément de réponse NR. Ceci est cohérent avec l'idée que les récepteurs nucléaires auxquels l’ADN est lié maintiennent l’helice H12 de trans-activation accessible pour le recrutement de la chromatine, la modification de co-régulateur de protéines qui agissent sur la région nucléosome assortis de l'ADN en aval.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Mots-clés libres:cryo-electron microscopy ; three dimensional reconstruction ; single particle ; nuclear receptor ; protein-DNA complex ; VDR ; RXR ; DNA
Sujets:CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique

UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-5 Santé, industrie du médicament, cosmétique
CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines

UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
Code ID:1881
Déposé le :16 Décembre 2010

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