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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Protéomique: maitrise de l'instrumentation, applications et étude des glycosylations

HOVASSE, Agnès (2010) Protéomique: maitrise de l'instrumentation, applications et étude des glycosylations. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

Pour répondre aux questions posées par les biologistes, la description des protéomes doit être de plus en plus précise au niveau des structures des protéines et en particulier des modifications posttraductionnelles. Malgré le grand nombre de méthodologies développées en analyse protéomique, la description d’un protéome reste souvent encore assez sommaire au vue de sa complexité structurale. La glycosylation apporte aux protéines un degré de complexité qui rend l’analyse des glycoprotéines particulièrement difficile principalement à cause de son hétérogénéité. Nous avons donc développé un ensemble de méthodologies qui permet, non seulement de déterminer les sites de N-glycosylation ainsi que les micro-hétérogénéités associées, mais qui est également adapté à l’étude d’échantillons disponibles en très petites quantités. Notre travail a principalement porté sur les points suivants : · L’identification d’un maximum de protéines grâce à une optimisation des méthodes nanoLCMS/MS pour des d'échantillons en très petites quantités ne permettant de réaliser qu’une seule analyse ; · La caractérisation des glycopeptides présents dans des mélanges complexes, en utilisant les ions diagnostiques spécifiques de la fragmentation des glycopeptides. Ces développements méthodologiques ont été appliqués à différents problèmes biologiques (Toxoplasma gondii, Vitis vinifera), et ont ainsi permis d'identifier et de caractériser des protéines et des glycoprotéines impliquées dans des processus biologiques clefs.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Discipline de la thèse / mémoire / rapport :Chimie analytique
Mots-clés libres:stratégies protéomiques ; spectrométrie de masse ; chromatographie liquide ; glycosylations ; caractérisation de proteines ; quantification
Sujets:UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-5 Santé, industrie du médicament, cosmétique
CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.6 Protéines

UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
Code ID:2025
Déposé le :08 Février 2011

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