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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Caractérisation structurale et fonctionnelle de déterminants de la capside du Grapevine fanleaf virus impliqués dans la transmission par Xiphinema index

SCHELLENBERGER, Pascale (2010) Caractérisation structurale et fonctionnelle de déterminants de la capside du Grapevine fanleaf virus impliqués dans la transmission par Xiphinema index. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

La transmission des virus est une étape cruciale du cycle viral. Le Grapevine fanleaf virus (GFLV) et l’Arabis mosaic virus (ArMV), les principaux agents de la maladie du court-noué de la vigne, sont transmis spécifiquement par deux espèces de nématodes, respectivement Xiphinema index et X. diversicaudatum. Des résultats antérieurs ont montré que la protéine de capside (CP) du GFLV détermine sa transmission. Pour caractériser les régions de la CP impliquées dans la vection du GFLV, nous avons combiné génétique inverse, modélisation 3D par homologie, cristallographie aux rayons X et cryomicroscopie électronique (cryo-ME). Plusieurs régions de la CP ont été échangées entre GFLV et ArMV. L’évaluation de la transmission des chimères a montré qu’une région de 11 résidus de la CP du GFLV est requise pour sa vection. Par ailleurs, la caractérisation d’un variant spontané du GFLV (TD) faiblement transmis, a révélé l’importance de la mutation Gly297Asp dans la transmission. La structure cristallographique du GFLV (3 Å) et du GFLV-TD (2,7 Å), montre que la perte de transmission du variant a pour origine la présence d’une chaîne latérale chargée négativement exposée à la surface du virus. Ces données suggèrent qu’une cavité de surface formée par le domaine B de la CP, serait le site de reconnaissance virus-vecteur. Enfin, la structure de l’ArMV a été obtenue par reconstruction 3D à partir d’images de cryo-ME. La comparaison du GFLV à l’ArMV suggère l’existence de différences structurales au niveau de la cavité. L’ensemble de ce travail ouvre de nouvelles perspectives de recherche visant à comprendre les bases moléculaires de la transmission des Nepovirus par nématodes.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Discipline de la thèse / mémoire / rapport :Sciences de la vie et de la santé. Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Mots-clés libres:nematode transmission ; Grapevine fanleaf virus ; x-ray crystallography ; chimeric coat protein ; crystal growth in gel ; RNA protection assay ; capsid protein determinant ; cryo electron microscopy
Sujets:UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-1 Agronomie, agroalimentaire, agriculture
CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique

CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 579 Micro-organismes, champignons, algues > 579.2 Virus
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 579 Micro-organismes, champignons, algues > 579.2 Virus

UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
Code ID:2063
Déposé le :19 Mai 2011

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