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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Contribution à la détermination de la structure de la sous-unité RPB11 de l’ARN polymérase II humaine.

NADERI, Kambiz (2011) Contribution à la détermination de la structure de la sous-unité RPB11 de l’ARN polymérase II humaine. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

L’ARN polymérase II (ARNP II) transcrit la quasi-totalité du génome nucléaire eucaryotique. L’ARNP II est un complexe constitué de 12 sous-unités. Une étape importante de son assemblage est la formation d’un hétérodimère entre les sous-unités RPB3 et RPB11. Nous avons examiné les interactions par double hybride entre les sous-unités RPB3 et RPB11, soit humaines, soit de levure, ainsi que l’effet de diverses mutations sur les interactions observées. Nous avons démontré que la protéine RPB11 humaine codée par le gène POLR2J1 forme un dimère stable, au contraire de son homologue de levure qui en est incapable. Nous avons constaté que les interactions observées ne sont pas sensibles aux mêmes mutations en particulier celles qui affectent un motif spécialement conservé nommé «motif alpha» que l’on retrouve jusque dans la sous-unité alpha de l’ARNP eubactérienne. Nous avons réussi à cristalliser cette protéine afin de contribuer à la détermination de la structure tridimensionnelle de l’ARNP II humaine. Nous avons caractérisé génétiquement l’ARNP II de Plasmodium falciparum en réalisant des tests de complémentation fonctionnelle des sous-unités de ce complexe enzymatique. Nos résultats indiquent que les sous-unités PfRPB4-5-7-9 et 12 codent des protéines capables de remplacer leurs homologues chez la levure Saccharomyces cerevisiae. De fait, nous avons construit des lignées de levures exprimant de façon stable des protéines de P. falciparum. Par ailleurs, les sous-unités PfRPB3-6-8-10 et 11 ne complémentent pas. Nous avons aussi construit des souches viables de levures dont le site de fixation de l’alpha-amanitine sur leur ARNP II est «plasmodifié» ou «humanisé».

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Discipline de la thèse / mémoire / rapport :Sciences du vivant. Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Mots-clés libres:ARN polymérase II ; transcription ; RPB11 ; RPB3 ; motif alpha ; cristallisation ; plasmodium falciparum ; complémentation fonctionnelle
Sujets:CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique

UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-5 Santé, industrie du médicament, cosmétique
UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
Code ID:2273
Déposé le :14 Novembre 2011

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