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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Mise en évidence et analyse d’un riboswitch appartenant à la famille des T-Box contrôlant l’expression des enzymes de la voie ARNt-dépendante de formation d’asparagine chez Clostridium acetobutylicum

SAAD, Nizar (2011) Mise en évidence et analyse d’un riboswitch appartenant à la famille des T-Box contrôlant l’expression des enzymes de la voie ARNt-dépendante de formation d’asparagine chez Clostridium acetobutylicum. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

Ce projet a permis de comprendre au niveau structural et mécanistique le fonctionnement du système d’antiterminaison chez Clostridium acetobutylicum et de conclure que ce mécanisme de régulation de l’expression des gènes est totalement dépendant du contexte physiologique de chaque espèce bactérienne. La redondance des gènes de la synthèse de l’Asn-ARNtAsn chez C. acetobutylicum a permis de révéler un mécanisme complexe de régulation de ces gènes en réponse au stress environnemental et aux changements physiologiques subis par C. acetobutylicum. Ce mécanisme est basé sur la régulation au niveau transcriptionnel de l’expression des gènes codant pour la voie indirecte de synthèse de l’Asn-tRNAAsn. Durant notre recherche on a montré que cette régulation est effectuée par un riboswitch de type T-Box spécifique d’un ARN de transfert, l’ARNtAsn. L’utilisation d’une combinaison d’études in vitro et in vivo, a permis de montré une ambigüité dans l’usage du codon au niveau de la «spécifier loop» de cette T-Box. Cette ambigüité permet la reconnaissance des deux espèces d’ARNt; l’ARNtAsn(GUU) et l’ARNtGlu(UUC). Enfin, la découverte de la synchronisation de 2 riboswitch de type T-Box est une découverte majeure qui permettra une avancée dans la compréhension du rôle de la T-Box dans son contexte cellulaire. Ces découvertes ouvrent la voie à une meilleure compréhension de la régulation des gènes chez les bactéries Gram positives pathogènes qui dans leur grande majorité utilisent ce riboswitch.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Discipline de la thèse / mémoire / rapport :Sciences du vivant. Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Mots-clés libres:riboswitch ; T-Box ; transfer RNA ; RNA world ; transamidation pathway ; transcription antitermination ; gram positive bacteria ; Clostridium acetobutylicum
Sujets:CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique
Classification Thèses Unistra > Santé > Sciences de la vie, biologie, biochimie > 570 Sciences de la vie. Biologie. Biochimie > 572 Biochimie > 572.8 Génétique biochimique

UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-5 Santé, industrie du médicament, cosmétique
UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
Code ID:2278
Déposé le :24 Novembre 2011

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