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Thèses et Mémoire de l'Université de Strasbourg

Analyse et exploitation de données de criblages de réactions chimiques pour la recherche de voies de synthèse

LIENHART, Yann (2011) Analyse et exploitation de données de criblages de réactions chimiques pour la recherche de voies de synthèse. Thèses de doctorat, Université de Strasbourg.

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Résumé

Les bases de données en chimie sont généralement centrées sur les molécules et les informations concernant les réactions sont extraites des publications scientifiques. Ces informations sont généralement disponibles dans des conditions expérimentales particulières et peu de données sont disponibles au sujet des réactions à faible rendement ou qui n’ont pas fonctionnées. En conséquence il peut être difficile de comparer les réactions et les transformations chimiques entre elles en raison de ces conditions expérimentales spécifiques et de ces données manquantes. Cette thèse a été financée par la société NovAlix (CIFRE), spécialisée en chimie organique et en biologie structurale. Afin d’explorer rapidement l’espace chimique et d’améliorer le processus de synthèse de molécules, deux méthodes d’expérimentation à haut débit ont été mises au point au sein de la société. Ces méthodes s’appuient sur la chromatographie en phase gazeuse et sur la spectrométrie de masse pour l’analyse des milieux réactionnels. La plate-forme informatique Magellan développée au cours de cette thèse est mise en œuvre grâce aux technologies Java Enterprise Edition et s’appuie sur une base de donnée centrée autour de la réaction chimique. Cet application permet la lecture, l’analyse et le stockage des données expérimentales récoltées par les méthodes d’expérimentation à haut débit de NovAlix et fournit des outils informatiques facilitant l’analyse des spectres expérimentaux et permettant la formulation de requêtes sur les expériences ainsi enregistrées.

Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Discipline de la thèse / mémoire / rapport :Bio-informatique
Mots-clés libres:chemo-informatique ; bio-informatique ; bases de données ; Java ; Java EE ; spectrométrie de masse ; chromatographie en phase gazeuse ; logiciel
Sujets:CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 540 Chimie, minéralogie, cristallographie > 547 Chimie organique > 547.2 Synthèse et réactions
Classification Thèses Unistra > Sciences, technologies > Sciences de la nature et mathématiques > 540 Chimie, minéralogie, cristallographie > 547 Chimie organique > 547.2 Synthèse et réactions

CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 000 Informatique, information, généralités > 004 Informatique
Classification Thèses Unistra > Sciences, technologies > Informatique, information, généralités > 004 Informatique

UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-2 Bio-industries, biotechnologies
Code ID:2418
Déposé le :05 Avril 2012

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